Sequencher Connections代表了一种对序列或序列组执行多沉分析的新步骤
。Connections扩大了Sequencher的职能，允许您设置能够运行使用分歧参数或数据库的分歧分析的“通路”
。通过同时对分歧通路上的多个序列或序列组运行分析，Sequencher Connections能够提高获得了局的速度
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Sequencher Connections此刻越发矫捷且可定造
。现有的Connections会话能够沉新打开并增长新的序列
。您的Connections会话能够沉定名以反映您的项目
。此刻有更多选项可用于将通路增长到Connections会话，并且还能够定名每个通路
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您能够在衔接会话中对单个序列进行BLAST搜索
Ｄ芄簧柚猛芬运阉饔涤蟹制绮问腘CBI数据库或每个通路使用的数据库
Ｄ芄簧柚帽镜谺LAST通路来搜索推算机上的数据库
。您还能够设置Primer-BLAST通路来设计感兴致区域的引物，并将这些引物序列发送到您的 Sequencher产品
。引物序列将拥有彩色碱基和利用于它们的引物特点
。该示意图在单个窗口中显示多个通路的了局，以便您比力分歧运行的了局
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您的Connections会话会自动与您的项目一路保留
。使用新的会话启动器，能够轻松创建新会话、向现有会话增长更无数据，或者单一地查看并沉新运行旧会话以查看是否有肆意新的感兴致序列已增长到您之前查问的数据库中
。使用示意图同时提供BLAST、Local-BLAST和 Primer-BLAST分析的图形概述
。同时打开多个会话的能力意味着您能够轻松查看所有了局
。当NCBI网站上的了局过期时，您能够确信它们依然安稳地存在于Connections中
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您能够在衔接会话中为一组序列运行MUSCLE比对
。了局能够视为比对序列或使用谱系图可视化
。分歧的通路能够设置使用分歧的参数
Ｄ芄唤蛄性龀さ较钟谢峄爸，以便分歧的行查看分歧的序列组
。而后能够比力分歧通路和行上的运行
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BLAST和Local-BLAST

BLAST可能是您一向使用的工具，但有好多参数和选项，您可能不会记住每个参数和选项的影响
。Sequencher Connections可援手您在更短的功夫内实现更多工作并比力您的了局
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您想比力分歧设置的了局吗？您想将搜索分成针对分歧数据库的单独查问吗？也许最近颁布了某些内容并且此刻已在数据库中，或者您可能对自己的数据相识了一些新内容
。Connections允许您同时运行很多分歧的数据库搜索，并在实现后尽快返回了局
。而后您能够保留所有了局并能够使用道理图对它们进行比力
。示意图是一个并行图形显示，以BLAST无法做到的方式显示单个序列的所有分析了局
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若是您能够通过一个序列实现所有这些行为，那么请思考一下在统一会话中能够使用多个序列做什么
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Primer-BLAST

使用Primer-BLAST分析序列并查抄特异性
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并行化您的分析 - 使用多组分歧的设置并同时运行一样的序列甚至分歧的序列，而无需编写剧本
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此刻，一键将您的数据保留到您的项目中
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您的新引物会自动标有GenBank风格的职能键，使它们在比对中更容易看到
。引物按方向进行色彩编码，以便您在使用时轻松鉴别，并且由于其定名约定，您始终不会混合它们
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MUSCLE and Trees

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当您想要寻找DNA序列中的守旧区域时，请寻找“MUSCLE”
。与很多其他多序列对准器相比，它速度快且精度更高
。它易于使用，通过 Sequencher Connections，您不仅能够看到对齐的区域，还能够以矩形或圆形树体式查看了局
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您能够在统一组序列上设置多个MUSCLE运行，并将每个分析（或通路）设置为使用分歧的参数
。您是否想将分歧的数据集保留在一路，但对它们运行一样的MUSCLE参数？将它们增长到统一个Connections会话中，由于会话中的每一行都能够蕴含分歧的序列组
。MUSCLE在分歧的通路和行上运行，而后能够进行比力，为您提供对数据的怪异视角
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