全新改进的搜索算法

• 选取优化后的搜索算法。

• 自动躲避同源区域与模板二级结构。

• 新增序列视图，可直观查看引物在模板上的地位。

• 选取全新改进的图形用户界面，提高使用履历。

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自动序列检索

支持通过 accession/GI 编号及查抄 ID，直接从 GenBank 和 dbSNP 急剧批量导入序列。利用多沉检索职能，也可从本地驱动器加载序列。

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自动躲避同源性与模板结构

用户可在法式内执行 BLAST 搜索及模板结构检测，两者的了局均用于引物设计。在引物设计过程中，系统会自动避开拥有显著交叉同源性和模板结构的区域。

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预设计引物评估

Primer Premier 可分析并评估预设计引物的各项属性，并对其进行排序，援手用户判断引物与指标值的靠近水平。该职能对使用已颁发或经现尝试证的引物尤其有效。支吃炖估蕴含多达 5 个错配的引物。

对于特定引物，Primer Premier 还能设计出兼容的配对引物。例如，对于预设计或已颁发的正向引物，软件可找到切合所有设计尺度的兼容反向引物。

用户无需输入模板序列即可评估正向/反向引物或引物对。软件会显示被分析寡核苷酸的所有属性，并可导出为 HTML 或 CSV 体式文件。引物按评分排序，便于用户判断其与指标值的匹配水平。

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手动引物搜索

Primer Premier 将引物设计的齐全节造权交给用户。通过手动引物搜索选项，用户可在模板序列上点击肆意核苷酸，即可在该地位获取引物。软件会设计一条 3' 端位于该核苷酸的引物并即时辰析其个性。引物长度也可按用户必要矫捷调整。对于诱变和克隆尝试，该职能有助于在受限区域内获得较优设计。Primer Premier 支持沿 DNA 序劣装滑动”引物，实时显示各项属性，援手用户直观定位搁置寡核苷酸的相宜地位。

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编纂模板序列

模板序列支持编纂。用户可使用尺度的剪切/复造/粘贴职能批改碱基，以精准定位指标区域。也可选中不必要的区域并点击删除按钮移除。法式允许用户为序列增长注解或标注，以备后续参考。

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序列视图

所选序列可按每块 3 或 10 个碱基、单链或双链方式显示。设计的引物以色彩象征：正义引物为蓝色，反义引物为红色。选定的 SNP 以粉色象征。同源区域以黄色高亮显示，参加模板结构的碱基以下划线标注。用户可将“序列视图”连同引物设计了局以 CSV 或 HTML 体式导出。

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天生汇报

用户可为设计的检测规划创建可用于演示的汇报，合用于尝试纪录或与同事共享信息。汇报可视化显示引物在序列上的地位，蕴含备选引物列表，并展示引物、扩增子及序列属性，以及引物设计法式所使用的设计参数。

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本地与桌面 BLAST 选项

用户可通过本地和桌面 BLAST 选项，将序列与本地自界说数据库进行比对。在推算机上创建文本或 FASTA 体式的序列数据库，并从 Primer Premier 中 BLAST 查问序列，了局随后可用于引物设计。此职能出格合用于不仅愿将数据提交到互联网或处置未颁发信息的情况。

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推算器

内置推算器可推算 GC 含量、显示碱基计数，并支持获取互补链和反向互补链。

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数据与数据库治理

支持创建多个项目，可针对每个尝试成立独立项目，便于治理多沉尝试数据。守护本地数据库，用于存储序列信息和搜索了局。

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