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CodonCode Aligner 11.0现已推出

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CodonCode Aligner是一款易于使用的法式,用于序列组装、沉叠群编纂和突变检验。CodonCode Aligner 11.0现已推出。

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CodonCode Aligner 11.0的新增职能:

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CodonCode Aligner 11.0版增长了Gibson Assembly、注解通用职能、序列起头的自动同步等等。

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Gibson Assembly
对虚构Gibson Assembly的支持允许您使用至多15个片段来仿照克隆尝试。

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载体、片段和产品序列能够显示为线性或圆形图,或在基础水平上。使用多个单一选项之一选择要克隆的区域,例如单击职能、回转现有选择、选择酶、输入碱基数或仅使用Shift键单击。

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视图左侧的工具栏按钮蕴含用于更改显示的图谱、特点和酶的选项,例如仅显示预约义的特点。

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至多增长15个片段,并凭据必要对其进行批改、排序或删除。

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凭据您的Tm和沉叠设置自动选择梦想引物。您还能够手动编纂引物,例如增长距离物或凭据必要调整读码框。

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图形概览显示您的载体、片段、引物和产品。

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在克隆尝试期间,选择直接导出引物和片段以及在CodonCode Aligner项目中创建哪些序列。

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查找并注解共同特点

对Aligner11中职能的更好支持蕴含检验和注解质粒中常见特点的选项。设置特点的类似度百分比以查找并选择要注解的特点:

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上面的示例显示了查找和注解拥有至少95%统一性的共同特点之前和之后的向量。

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同步启动

同步循环序列肇始地位的职能能够轻松分列和比力类似的样本。下面的示例显示了两个向量,它们拥有一些类似之处,但在同步起头之前和之后的起头地位分歧:

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若是您愿意,此刻还能够手动设置肇始基准,而不是使用自动同步职能。

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更多的...

  • 从GFF文件导入特点
  • 设置循环序列的起点
  • 更好地对齐圆形序列
  • 导入最近的文件

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2023-08-10 14:21
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