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Endeavour 软件:从粉末衍射数据解析晶体结构的齐全职能

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软件用处

Endeavour 是一款用于从粉末衍射数据或单晶衍射数据中解析晶体结构的软件,选取全局优化步骤,同时最幼化推算衍射图谱与实测衍射图谱之间的差距以及系统的势能(即“帕累托优化”)。

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结构解析职能

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  • 数据起源:支持通例 X 射线尝试室衍射仪、同步辐射、中子或电子衍射数据。

  • 输入要求

    • 晶胞参数;

    • 衍射数据:粉末衍射数据(布拉格角处的积分强度,非步进扫描概括数据,可从 Philips、Bruker-AXS、Stoe 等导入)或单晶衍射数据(I(hkl)、|F(hkl)| 或 F?(hkl),可从 SHELX 文件导入);

    • 晶胞内容(化学组成或分子结构及分子式单元数)。

  • 使用便捷性:提供“向导”职能,便于筹备输入数据;自动调整所有结构解析推算参数。

  • 图谱推算改进:从尝试和推算峰列表推算衍射图谱概括,而非仅比力有关峰的强度。这使得 R 因子推算对 2θ 误差和谬误峰位匹配的敏感性大幅降落。在早期版本中,此问题常导致 R 因子值谬误,严沉时可能故障整个晶体结构解析。

  • 自动空间群确定:从解析了局中自动判定空间群。

  • 2θ 误差校对:可选或自动查抄和校对 2θ 误差。

  • 峰有关性自动查抄:可。掀粲茫。

  • 高阶设置:提供多种高阶参数,如柔性分子、跳跃宽度、峰三角形、仿照退火参数等,可通过结构解析向导接见。

  • 分子/刚体支持:含分子或刚体的晶体结构现可直接在高于 P1 的空间群中解析,即便原子需搁置在特殊地位上。

  • 中央步骤查看:可查看结构解析过程的中央步骤,蕴含进度(实现百分比)、R 值和总体价值函数、有关推算峰与观测峰列表、结构图片和衍射图谱,布局可由用户自界说分列。

  • 自动构建:Auto Build 职能可可视化每个中央步骤的晶体结构,例如晶胞(可选显示键、多面体、分子等)。

  • 了局汇报:汇报视图以体式化文本显示帕累托优化了局,可复造到剪贴板、保留或打印。

  • 势参数处置:支持势参数(单一倾轧、Lennard-Jones)的编纂、推算与拟合。现已实现所有元素对组合的最幼原子间距(源自 Pearson 晶体数据),无需手动调整单一倾轧势参数。

  • 分子与原子晶体结构支持:分子可固定在特定地位并可绕参考原子旋转。

  • 对称性查找:支持自动或交互式转换到更高空间群。

  • 单独优化:可仅通过能量最幼化或仅通过衍射数据进行结构解析。

  • 可旋转键选择:在结构解析推算中,可手动选择分子内的可旋转键进行变动。

  • 分子结构导入:支持从多种文件体式导入三维分子结构,蕴含 Diamond(.dsf)、Cambridge CSD-FDAT(.dat、.fdat、.csd)、MDL Molfile/SDFile(.mol、.mdl、.sd)、Cerius2 CSSR(.cssr、.dat)、Sybyl MOL/MOL2(.mol、.mol2)和 CIF(.cif)。也可使用 ACD ChemSketch Freeware 绘造分子并转换为三维结构(可从 Endeavour 1.x CD-ROM 装置)。

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结构可视化职能

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  • 自动构建设置:结构可视化“自动构建”职能的设置现可凭据所钻研化合物的化学个性自动调整。

  • 数据输入与批改:支持手动输入或批改结构参数和文件数据。

  • 数据导入:从多种晶体结构数据库(无机晶体结构数据库、剑桥结构数据库、蛋白质数据库)、Pauling File(无机资料数据库)、CIF 文件、SHELX 体式及多种分子结构体式导入结构数据。

  • 晶胞天生:创建晶胞、超胞或晶格肆意领域的内容。

  • 衔接性分析:通过直方图辅助会商衔接性,显示选定原子类型间距离散布,并自动推算距离领域。

  • 配位层补全:补全选定原子周围的配位层。

  • 分子天生与补全:天生分子或补全被晶胞边缘裁剪的分子片段(堆积图)。

  • 模型类型:支持球棍模型、线状模型和空间填充模型。提供中心投影或平行投影、深度提醒和立体显示。

  • 光照渲染:基于 OpenGL 的光照模型,支持用户自界说光源和材质属性。

  • 使用交互:旋转、平移和缩放支持鼠标节造、键盘步进或数值输入?裳刂付ㄖ峄虺 hkl 平面查看。

  • 配位多面体:可萦绕选定原子天生或手动构建配位多面体,面可为阴影、不通明或通明。

  • 热椭球显示:显示各向异性位移参数的热椭球。

  • 标注与形状:原子和键可增长标签;原子和键的色彩、形状和半径可按类型统一设置或单独指定。

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通用职能

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  • 界面:32 位 Windows 利用法式,选取选项卡式多文档界面(MDI),支持高低文菜单和工具栏,可“同时”处置多个结构。

  • 布局:用户可自界说结构图片、衍射图谱及多种文本数据的并列排布。

  • 撤销/沉做:支持多步撤销和沉做职能。

  • 丈量:推算或交互式丈量距离、角度和二面角(含尺度不确定度)。

  • 导出:支持导出为晶体与分子结构体式、峰位与 |F(hkl)| 体式、Windows 图元文件、多种位图体式以及 VRML 体式。

  • 在线更新:支持自动或手动在线更新。

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系统要求

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  • 系统:MS Windows? XP、Vista、Windows 7、8/8.1 或 10(不支持 Windows RT、Windows 10 S 或 Windows 10 的“S 模式”)

  • Microsoft Internet Explorer 5.01 或更高版本

  • 64 MB RAM

  • 100 MB 可用硬盘空间

  • 显卡:1024×768 像素,32768 色(“高彩色”)

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2026-07-10 10:00
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