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分子建模软件包Spartan' 20 改进的处所

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Spartan' 20改进的处所!从Spartan' 20 版本起头,许可证都是“并杏妆许可证(使用多个内核),Spectra和属性数据库(SSPD)。“单核”版本已停产。

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Spartan' 20 Parallel Suite的新职能

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NMR.

Boltzmann Averaged NMR.已经执行了一种新的用于推算构象柔性分析的NMR化学位移。通过从提供与尝试匹配的质子和13C化学位移的低能构象体中进行选择,代替了玻尔兹曼沉量的推算(Spartan' 18中颁布的纪录中的迟徐行骤)。

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合成化学家对NMR光谱的用处是为“已知”反映成立立体化学(有时是区域化学)。通过将自动异构体天生与先前或新的处置构象柔性分子的规划结合起来,Spartan' 20能够一步实现,从异构体的单个构象体起头质子和13C化学位移已经构象异构体的均匀数(或在新规划的情况下。适合尝试数据)  D芄徊槌璂P4分数,以确定哪种异构体适合尝试质子和/或13C化学位移。

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耦合常数;谕扑愕鸟詈铣Jㄏ惹霸赟partan' 18中可用)基于2键和3键CH耦合常数的经验关系。只管早就能够使用3键HH耦合常数的经验(类似karplus的)关系(在Spartan中),这位CH耦合常数提供了复杂数据。

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2D NMR光谱。2DNMR光谱,COZY(质子 vs 质子)和HMBC(13C vs 质子),基于推算的化学位移以及推算或经验估计的HH和CH耦合常数。带有或不带有尝试耦合的2D显示器。

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数据库

天然产品数据库。天然产品数据库,拥有构象均匀的NMR光谱和尝试光谱。

此刻约莫有3,500化合物(并且还在不休增长,在用新的文件进行更新,因而在未来几年中它会适度增长)。

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Spartan光谱与数据库(SSPD)。Spartan光谱与职能数据库(SSPD)子集(随法式自动装置)以扩大,以ωB97X-D/6-31G*模型结构的红表频率。此刻来自ωB97X-V/6-311+G(2df,2P)能量的能量(作为属性)。这些属性能够闯辗视性质和反映中获得。

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基础设施

与尝试耦合常数的输入以及推算值有关的比力/确认有关的附加职能产生了为Spectra Data的新菜单。

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图形界面

天生异构体。新工具提供了自动立体异构体/区域异构体的具体信息。输入物由带有象征的单个分析(异构体)组成,以批示要回转的中心(立体异构体)和要建饰的键(区域异构体)。了局是异构体列表。而后,该列表能够以a/an的大局提交:

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平衡构象推算得出异构体的构象列表构象散布推算得出异构体的玻耳兹曼加权构象列表通过NMR得出异构体的DP4分数。

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未来的发展将把这一点扩大到反映,自动产生对异构体产品的过渡态的猜测。

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2D图纸。Spartan衍生的二维图纸(从草图天生器)已得到改进,以允许一位用户选项增长推算数(单到双,双到三);雇üㄗ佣钥固寤У纳杓平辛烁慕,用于能够立即用楔子构建,而不用批改现有的键。推算的HH和CH耦合的可视化已经在二维和三维中实现,尝试位移的用户输入也已经在二维中实现。

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输出提要。这种HTML暗示体式已经得到了改进,由于一些数据表在打开时是动态推算的。

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推算加强的并行处置

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核磁共振和频率对并行机能进行了改进,以前在约莫10个核上看到了机能不变。此刻在约莫15个核(能量和几何推算)处起头不变。随着芯片中可随时获得的主题数量的不休增长。

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不久的未来。对频率码的并行机能进行了适度的改进。

未来的开发工作NMR代码的并行化。

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Spartan' 20 Parallel Suite将利用16个内核来进行并行作业,并且能够选择许可超过16个内核(合用于多核系统),对新的Q-Chem版本(5.2.1假造本清单时),是持续合作的了局(与2002年颁布的Spartan' 02起头)。通过这种合作,客户将从Spartan代码库中的GUI加强职能中受益,以及Q-Chem中的推算步骤和现代推算步骤的领域不休扩大。

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2021-03-24 14:56
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